湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序 均为德尔塔毒株

湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序 均为德尔塔毒株

  新湖南独家丨湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株,与南京高度同源

  湖南日报·新湖南客户端8月2日讯 (记者 张春祥 通讯员 张亚娜 李世康) 记者今日获悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控中心已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。

  5天时间已完成20例标本测序

  据省疾控中心检验科科长湛志飞介绍,基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发的重要工具。通过构建进化树,研究不同患者病毒遗传序列变化,能在分子生物学层面揭示病毒的传播方式,分析新冠病毒的进化来源,研究新冠病毒的致病病理机制,为控制疫情暴发提供科学依据。

  通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对,可以初步判断其地域来源。将序列与既往病例序列进行比对,如果序列在同一进化树分支上,则可以判断这些病例是否来自同一传播链或传染源。

  面对此次疫情,从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控已完成20例标本测序。

  24小时完成病毒基因测序溯源

  “新冠病毒样本送到实验室后,一般需要经过多个步骤完成检测。”湛志飞称,在接到阳性样本后,工作人员首先进行复核工作,对样本进行核酸提取,再用两种试剂进行核酸检测。复核阳性的标本,分别用二代和三代高通量测序技术进行序列测定,为病毒溯源工作设置“双保险”,确保万无一失。

  病毒基因序列测定完成后,工作人员还要马上进行生物信息学分析,将病毒序列与数据库中的序列进行比对,查看有无变异位点,进行同源性比较。完成数据比对后,还要及时撰写溯源报告。

  “目前,湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力,为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供了强大的技术支撑。”湛志飞介绍,去年10月份才掌握这项技术,以前都是送到国家疾控中心检测。目前湖南省疾控中心培养了3名技术骨干,所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成,情况复杂的也不会超过48小时。根据疫情的变化,只要有标本来,都会在24小时内启动测序流程。

  测序结果与南京高度同源

  7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序工作以来,省疾控中心立即组织专业技术人员,日夜不停地开展测序工作,通过文库制备、簇生成、上机测序与数据比对分析,已经完成测序结果的标本均为德尔塔毒株。从国家疾控中心反馈的结果显示,和江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。

  根据最新疫情通报,2021年7月20日0时至8月1日24时,湖南省累计报告新型冠状病毒肺炎确诊病例22例(境外输入3例)。此次疫情病原体为德尔塔变异株,范围广、来势猛,广大民众一定不能掉以轻心,严格执行好持码进出、测量体温、佩戴口罩、保持距离等措施,有效降低病毒传播风险,减少不必要的人员聚集。

【编辑:朱延静】